باکتری‌های روده، که به عنوان میکروبیوم روده نیز شناخته می‌شوند، مجموعه‌ای از میکروارگانیسم‌ها هستند که در دستگاه گوارش انسان زندگی می‌کنند. این باکتری‌ها به هضم غذا، تولید ویتامین‌ها و حفظ سلامت سیستم ایمنی کمک می‌کنند. این باکتری‌ها به دو دسته اصلی تقسیم می‌شوند: باکتری‌های مفید و باکتری‌های مضر. باکتری‌های مفید مانند لاکتوباسیلوس و بیفیدوباکتریوم به بهبود سلامت روده کمک می‌کنند، در حالی که باکتری‌های مضر می‌توانند باعث عفونت و بیماری شوند. تعادل بین این دو نوع باکتری برای حفظ سلامت کلی بدن ضروری است.