فلور روده به مجموعه‌ای از میکروارگانیسم‌ها، از جمله باکتری‌ها، قارچ‌ها و ویروس‌ها اشاره دارد که در روده‌های انسان و سایر حیوانات زندگی می‌کنند. این میکروبیوم به هضم غذا، تولید ویتامین‌ها و حفظ سلامت سیستم ایمنی کمک می‌کند. توازن فلور روده برای سلامتی بسیار مهم است. تغییرات در این توازن می‌تواند منجر به مشکلات گوارشی، بیماری‌های خودایمنی و حتی اختلالات روانی شود. تحقیقات نشان می‌دهد که تغذیه، استرس و مصرف آنتی‌بیوتیک‌ها می‌توانند بر فلور روده تأثیر بگذارند.