پاپائین یک آنزیم پروتئاز است که عمدتاً در میوه پاپایا یافت می‌شود. این آنزیم به تجزیه پروتئین‌ها کمک می‌کند و به همین دلیل در صنایع غذایی و دارویی مورد استفاده قرار می‌گیرد. پاپائین می‌تواند به عنوان یک نرم‌کننده گوشت و همچنین در تولید مکمل‌های غذایی به کار رود. این آنزیم همچنین خواص ضد التهابی دارد و ممکن است در درمان برخی بیماری‌ها مفید باشد. به دلیل توانایی آن در هضم پروتئین‌ها، پاپائین به عنوان یک مکمل در رژیم‌های غذایی برای بهبود هضم و جذب مواد مغذی استفاده می‌شود.