خودکار مدافعتی بیماری به وضعیتی اشاره دارد که در آن سیستم ایمنی بدن به اشتباه به بافت‌های سالم خود حمله می‌کند. این نوع بیماری‌ها می‌توانند منجر به التهاب و آسیب به اعضای مختلف بدن شوند. برخی از نمونه‌های رایج این بیماری‌ها شامل لوپوس و آرتریت روماتوئید هستند. علت دقیق خودکار مدافعتی بیماری‌ها هنوز به‌طور کامل مشخص نیست، اما عوامل ژنتیکی، محیطی و عفونت‌ها می‌توانند نقش داشته باشند. درمان این بیماری‌ها معمولاً شامل داروهایی است که سیستم ایمنی را سرکوب می‌کنند یا التهاب را کاهش می‌دهند.